Courtesy of NatureMagazine

MetaGraph: Mesin Pencari DNA yang Membuka Era Baru Penelitian Biologi

Menciptakan alat pencarian bioinformatika yang mampu mengakses, mengindeks, dan menyaring ribuan miliar data urutan DNA, RNA, dan protein secara cepat dan efisien, sehingga ilmuwan dapat menelusuri konteks biologis dalam data besar secara real-time.

08 Okt 2025, 07.00 WIB

170 dibaca

Ikhtisar 15 Detik

MetaGraph memudahkan akses dan analisis data sekuens biologis yang sangat besar.
Penggunaan graf matematis memungkinkan peneliti menemukan pola genetik yang tersembunyi.
MetaGraph telah digunakan untuk penelitian penting, termasuk analisis resistensi antibiotik dalam mikrobioma.

Zurich, Swiss - MetaGraph adalah sebuah mesin pencari revolusioner yang dibuat untuk mengakses dan mengindeks data sekuensing biologis dalam jumlah yang sangat besar, seperti DNA, RNA, dan protein. Alat ini membantu ilmuwan mencari pola genetik dalam data besar yang sebelumnya sangat sulit diurai karena data tersebut sangat banyak, terfragmentasi, dan berisik.

Dibandingkan dengan Google yang mengindeks halaman web, MetaGraph mengindeks milyaran huruf DNA dari berbagai organisme hidup, mulai dari virus hingga manusia. Kata Rayan Chikhi, fitur MetaGraph lebih mirip dengan mesin pencari YouTube karena mampu menemukan pola tersembunyi tanpa harus ada anotasi atau kata kunci secara eksplisit.

Data yang digunakan MetaGraph berasal dari tujuh database publik besar yang mengandung hampir 19 juta set DNA dan RNA dan ratusan miliar urutan protein. Informasi ini kemudian dihubungkan dengan menggunakan konsep matematis berupa graf yang menggabungkan fragmen yang tumpang tindih seperti indeks dalam buku.

Dengan teknologi ini, peneliti dapat mencari hubungan biologis dalam data yang sangat besar secara efektif dan cepat, contohnya MetaGraph mampu memeriksa ratusan ribu sampel mikrobioma usus manusia dalam waktu sekitar satu jam. Hal ini mempercepat riset tentang gen resistensi antibiotik dan banyak aplikasi biologis lainnya.

MetaGraph membuka jalan baru dalam penelitian biologi modern dengan memudahkan akses ke data sekuensing yang besar dan rumit. Dengan ini, akademisi dan peneliti bisa menemukan informasi penting yang sebelumnya tersembunyi dalam data, sehingga mempercepat kemajuan di bidang medis, bioteknologi, dan ilmu hayati.

Referensi:
[1] https://nature.com/articles/d41586-025-03219-w

Analisis Ahli

Rayan Chikhi

"MetaGraph menetapkan standar baru dalam analisis data biologis mentah, memberikan kemampuan yang sebelumnya tidak mungkin untuk mengakses dan menganalisis data dalam skala yang sangat besar."

Analisis Kami

"MetaGraph merupakan lompatan inovatif dalam bioinformatika yang secara fundamental mengubah cara ilmuwan berinteraksi dengan data sekuensing besar. Kemampuannya untuk mencari pola tersembunyi tanpa anotasi membuka jalan bagi penemuan biologis yang lebih dalam, sekaligus mengatasi kendala utama dari ledakan data di bidang ini."

Prediksi Kami

Ke depan, MetaGraph akan mempercepat penemuan ilmiah di bidang genetika dan mikrobioma, serta mendukung pengembangan medis dan bioteknologi dengan memungkinkan akses cepat ke data sekuensing besar yang sebelumnya sulit diolah.

Pertanyaan Terkait

Apa itu MetaGraph?

MetaGraph adalah mesin pencari yang dapat menyaring data biologis dari repositori publik dengan cepat.

Mengapa MetaGraph penting dalam analisis data biologis?

MetaGraph penting karena membantu mengatasi masalah aksesibilitas dan mengurangi kompleksitas dalam menganalisis data sekuens yang sangat besar.

Siapa yang mengembangkan MetaGraph?

MetaGraph dikembangkan oleh para peneliti di Swiss Federal Institute of Technology (ETH) Zurich.

Apa tujuan dari penggunaan MetaGraph?

Tujuan dari penggunaan MetaGraph adalah untuk membantu peneliti mengajukan pertanyaan biologis menggunakan repositori data sekuens yang besar.

Bagaimana MetaGraph membantu dalam penelitian tentang mikrobioma?

MetaGraph membantu dalam penelitian tentang mikrobioma dengan memungkinkan analisis cepat dari sampel mikrobioma manusia untuk indikator resistensi antibiotik.