Cetak Biru Kehidupan Baru

Pomodo.id - AI telah membuktikan kekuatannya dalam menjelajahi dan menganalisis data genetik dengan cara yang belum pernah dilakukan sebelumnya. Tim ilmuwan dan agen AI dari perusahaan Anthropic baru saja mengumumkan penemuan pola DNA baru yang ditemukan dalam genom virus raksasa. Temuan ini menunjukkan kemiripan dengan pola yang terdapat dalam sistem kekebalan CRISPR pada mikroba. Meskipun penemuan ini masih dalam tahap awal, ia memberikan wawasan baru tentang bagaimana AI bisa membantu dalam pengembangan alat pemotongan gen yang mungkin lebih baik di masa depan.

Penelitian terbaru mengidentifikasi ribuan protein pendek yang sebelumnya tidak dikenali sebagai bagian dari genom manusia dan memberikan nama baru, peptideins. Temuan ini berasal dari analisis konsorsium TransCODE yang meninjau 7.264 DNA sequences dan menemukan 15 yang memiliki bukti kuat sebagai protein kodig. Pengakuan ini penting karena protein ini bisa berperan dalam penyakit dan fungsi seluler yang belum diketahui.

Para ilmuwan berhasil merekayasa bakteri Escherichia coli menggunakan hanya 19 dari 20 asam amino dengan menghilangkan isoleusin dari ribosomnya. Teknologi ini sebanding dengan menghilangkan huruf umum dari naskah klasik sambil tetap mempertahankan arti dan fungsi.

Craig Venter, ilmuwan yang memimpin perlombaan pengurutan genom manusia pada 1990-an, meninggal pada 29 April. Ia terkenal karena pendekatan revolusioner whole genome shotgun sequencing yang mempercepat proses pemetaan genom. Perlombaan dengan Human Genome Project berakhir dengan kesepakatan diplomatis yang diprakarsai oleh Presiden Bill Clinton.

Studi terbaru menggunakan pembelajaran mesin untuk memprediksi protein antivirus dalam genom bakteri dan menemukan bahwa sekitar 1,5% gen bakteri terkait imun antivirus, tiga kali lipat estimasi lama. Kedua tim peneliti menggunakan model canggih pada ribuan genom bakteri, termasuk 17.000 genom dan 69 strain E. coli. Penemuan ini mengungkap keragaman sistem pertahanan yang jauh lebih besar dari sebelumnya dan memunculkan potensi inovasi bioteknologi.

Para peneliti dari J. Craig Venter Institute berhasil menciptakan 'sel zombie' Mycoplasma capricolum yang mati dengan mengganti genomnya menggunakan genom sintetis dari Mycoplasma mycoides. Mereka menggunakan obat mitomycin C untuk menonaktifkan genom penerima sehingga sel tidak dapat menggunakan mekanisme rekombinasi untuk bertahan hidup, memastikan keberhasilan transplantasi genom donor.

Peneliti berhasil membuat simulasi komputer yang meniru hampir seluruh reaksi kimia dalam sel bakteri JCVI-syn3A yang memiliki genom minimal. Simulasi ini memungkinkan pemahaman mendalam tentang bagaimana molekul seperti DNA, protein, dan ribosom berinteraksi selama siklus pembelahan sel. Simulasi berlangsung selama 105 menit virtual yang mewakili siklus hidup pembelahan bakteri.

Para peneliti berhasil membuat simulasi komputer yang mencakup hampir seluruh reaksi kimia dalam sebuah sel bakteri dengan genom minimal. Simulasi ini memperlihatkan bagaimana sel tersebut menyalin DNA dan membelah diri menjadi dua bagian.

Peneliti menggunakan model AI Evo2 yang dilatih pada triliunan huruf DNA untuk mendesain genom sintetis, termasuk genom yang terinspirasi oleh Mycoplasma genitalium. Hasil desain ini menunjukkan kemampuan AI dalam membuat urutan gen baru yang sebelumnya belum pernah ada di alam secara komputasi.